Krieg in der Galaxie: Während die Jedi-Ritter auf Seiten der Galaktischen Republik kämpfen, haben sie es mit den Separatisten, unter Führung von Count Dooku, zu tun. Unter Führung des Großmeisters Yoda müssen sich Mace Windu, Obi-Wan Kenobi, Anakin Skywalker und viele weitere Jedi im Kampf gegen die finsteren Mächte und für die Sicherheit der Republik bewähren. Unterstützung erhalten sie von den Klonkriegern, die dem Kanzler Palpatine treu zur Seite stehen – doch der verfolgt im Versteckten seine eigenen Ziele.