Eines Tages trifft der Oberschüler Yomogi Asanaka auf einen seltsamen Mann namens Gauma, der von sich selbst behauptet, ein »Monstrenbändiger« zu sein, und als solcher die Fähigkeit besitzt, riesige Monster zu manipulieren. Weil seine Kräfte jedoch nachgelassen haben, muss er andere Mittel und Wege finden, seine Erzfeinde – die Monstreneugeniker – zu bekämpfen. Diese verfolgen das Ziel, die Kaijuu genannten Monster zu den Herrschern über die Welt zu machen, indem sie die Monster mit ihrer Fähigkeit »Instance Domination« kontrollieren.

In seiner Welt erhielt Gauma ein Ornament, mit dem er den Kampfroboter Dynazenon beschwören kann. Um ihn steuern zu können, braucht es jedoch vier Piloten – auch aus dem Grund, weil Dynazenon sich in vier voneinander unabhängige Einzelteile in Form dreier Vehikel und eines mechanischen Drachen aufspalten kann. So kommt es, dass Gauma nicht nur Yomogi, sondern auch dessen Klassenkameradin Yume Minami und den 33-jährigen NEET Koyomi Yamanaka zu seinen Co-Piloten auserwählt.

Abseits von den Kämpfen gegen die Kaijuu und die Monstreneugeniker haben Yomogi und seine Freunde aber auch persönliche Probleme zu bewältigen. So versucht Yume, genauere Details über den Tod ihrer Schwester Kano herauszufinden. Bei ihren Nachforschungen kommen sie und Yomogi sich immer näher …

Anmerkung:
Ebenso wie das 2018 veröffentlichte »SSSS.Gridman« spielt auch »SSSS.Dynazenon« im gemeinsamen »Gridman-Universum«.
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