Mushi sind Wesen, die man weder als Tiere, Pflanzen, Insekten noch Geister bezeichnen kann. Sie existieren in unterschiedlichsten Arten und Formen auf der Welt und leben in Städten, der Natur, in Gewässern oder in der Luft meist friedlich neben Pflanzen, Tieren und Menschen. Doch manche Arten finden aus Versehen, manche auch gezielt, den Kontakt zu Menschen und gehen eine Verbindung ein, die für Letztere eher als schlecht bezeichnet werden kann. Der Protagonist Ginko ist ein Mushishi, eine Art Arzt und Gelehrter, der sich auf die Erforschung und Austreibung von Mushi spezialisiert hat. Er streift durch das Land, sammelt dabei Information und rettet oftmals von Mushi befallenen Menschen das Leben oder befreit sie zumindest aus einer unangenehmen Situation, die durch Mushi hervorgerufen wurde.
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